Wir schreiben das Jahr 2151. Jonathan Archer bekommt das Kommando auf dem ersten Raumschiff mit Warp-5-Antrieb - der Enterprise NX-01. Gemeinsam mit seiner 80-köpfigen Crew erforscht er die unendlichen Weiten des Weltraums, um den Weg für einen interstellaren Völkerbund zu ebnen. Ihm zur Seite stehen u. a. sein Hund Porthos, die vulkanische Wissenschaftsoffizierin T'Pol, sein Chefingenieur und Vertrauter "Trip" Tucker und der medizinische Offizier Dr. Phlox.

Als die Besatzung der Enterprise auf ihrer Forschungsmission ein fremdes Raumschiff entdeckt, freut sie sich darauf, an Bord zu gehen. Allerdings treffen Archer und seine Crew auf etwas ganz anderes als erwartet: Die gesamte Mannschaft des Schiffes ist tot. Dr. Phlox findet durch Untersuchungen heraus, das es sich bei den Ermordeten um eine humanoide Rasse handelt, der eine Flüssigkeit entnommen wurde, die der menschlichen Lymphflüssigkeit sehr ähnelt ...

Die Enterprise ist auf direktem Kurs zu einem neuen Planeten, den sie erforschen soll. Das Erkundungsteam, bestehend aus Tucker, Travis, T'Pol, Ethan und Elizabeth, beginnt auch gleich mit seiner Expedition, muss aber in der Nacht in eine Höhle flüchten, weil ein heftiger Sturm tobt. Dort glauben Travis und Tucker, seltsame Steinwesen zu sehen, die sich mit T'Pol unterhalten. Tucker ist der festen Meinung, die Vulkanierin spiele ein falsches Spiel und hecke etwas aus ...

Chefingenieur Tucker wird an Bord eines Raumschiffes der Xyrillianer gebracht, um dort bei der Behebung eines technischen Defektes zu helfen. Obwohl die Außerirdischen durchaus gastfreundlich sind, hat Tucker Probleme mit ihren Eigenarten. Erst die Bordingenieurin Ah'Len lässt ihn Gefallen an seiner Mission finden. Die beiden verstehen sich auf Anhieb und verbringen viel Zeit miteinander. Als Tucker wieder auf der Enterprise ist, macht er eine seltsame Entdeckung ...

Die Crew der Enterprise fliegt Richtung Terra Nova, einen Planeten, auf dem sich vor langer Zeit Menschen niederließen, die das Leben auf der Erde satt hatten. Nachdem man schon seit Jahren nichts mehr von diesen Auswanderern hörte, möchte Captain Archer nach dem Rechten sehen. Bereits kurz nach der Landung muss die Crew feststellen, dass die einst gegründete Stadt menschenleer ist - vermutlich wegen hoher radioaktiver Strahlung, die jedes humanoide Wesen ausgelöscht hat ...

Captain Archer besichtigt mit einigen Kollegen das vulkanische Kloster eines bislang unbekannten Sterns. Während ihres Besuches wird die Gruppe von Andorianern gefangen genommen, einem mit den Vulkaniern auf Kriegsfuß stehenden Volk. Diese vermuten, die Vulkanier hätten im Kloster Langstreckensensoren versteckt, mit denen sie einen Angriff auf die Andorianer starten wollen. Als Captain Archer sieht, wie brutal die Geiselnehmer vorgehen, ruft er die Enterprise zu Hilfe ...

Auf ihrer Fahrt durch die unendlichen Weiten des Weltraums entdeckt die Crew der Enterprise ihren bislang größten Kometen. Als Captain Archer das Objekt näher erforschen will, bemerkt er in der Nähe ein vulkanisches Raumschiff. Captain Vanik, der Leiter der anderen Mannschaft, gibt an, ebenfalls an der Erforschung des Kometen interessiert zu sein. Während der ganzen Vorkommnisse wirkt T'Pol extrem in sich gekehrt. Hat ihr Verhalten vielleicht etwas mit Vanik zu tun?

Es ist eine kleine Sensation, als die Crew der Enterprise auf ihren Flügen durch das All einen Planeten entdeckt, auf dem sich Lebewesen befinden. Diese ähneln der menschlichen Rasse so sehr, dass sich das Team nur leicht schminken muss, um auf dem Planeten unbemerkt Forschungen anstellen zu können. Captain Archer, T'Pol und "Trip" mischen sich sogleich unter das Volk und gehen dabei den Signalen eines Antimaterie-Reaktors nach, der zur Sprengstoffherstellung dient ...

Die Enterprise erreicht ein Notruf, der von dem Raumschiff-Frachter Fortunate ausgesendet wurde. Sofort eilen Captain Archer und seine Leute der fremden Besatzung zu Hilfe. Es stellt sich heraus, dass die Fortunate von den Nausicaanern angegriffen wurde. Obwohl der Captain bei der Attacke verletzt und der Frachter beschädigt wurde, will der Erste Offizier Ryan die Hilfe von der Enterprise nicht so recht annehmen. Archer findet schon bald den Grund dafür heraus ...

Die Enterprise nimmt eine Gruppe Pilger an Bord, die ein Naturspektakel beobachten wollen, bei dem einer der Protosterne eine Unmenge Neutronen entlässt. Voller Stolz präsentiert "Trip" den Gästen zunächst die technischen Errungenschaften des Raumschiffs. Dabei macht sich einer der Ankömmlinge an einem Kabel zu schaffen. Kurz darauf kommt es zu einem Spannungsstoß, der sich in unzähligen Explosionen entlädt, die anscheinend unaufhaltsam auf den Hauptreaktor zurasen ...

Gerade als Captain Archer in den Vorbereitungen zu Malcolm Reeds Geburtstag steckt, nähert sich der Enterprise ein Raumschiff mit hoher Geschwindigkeit. Genauso schnell, wie das Schiff aufgetaucht ist, verschwindet es auch wieder. Archer beschließt, lieber zur Erde zurückzukehren und das Schiff aufrüsten zu lassen, um sich in Zukunft besser wehren zu können. Doch dazu bleibt keine Zeit, denn schon kurz darauf wird die Enterprise von feindlichen Aliens angegriffen ...

Auf ihrem Flug durch das All kreuzt die Enterprise den Weg eines scheinbar führerlosen Raumschiffes. Es stellt sich heraus, dass zwei äußerst schwache Astronauten an Bord des Schiffes sind. Diese erzählen dem denobulanischen Arzt Dr. Phlox, dass die Bevölkerung ihres Heimatplaneten Valakis an einer schlimmen Krankheit leidet, von der auch sie befallen sind. Die Astronauten bitten Captain Archer, den Valakianern zu helfen, indem er ein Gegenmittel herstellen lässt ...

Als die Enterprise im Orbit auf ein unbekanntes Raumschiff mit stark beschädigter Außenhülle trifft, begeben sich Reed, Hoshi und T'Pol an Bord des fremden Schiffes, um der Crew zu helfen. Zu spät bemerken sie, dass es sich dabei um ein Raumschiff der kriegerischen Klingonen handelt - eine Klingonin flieht mit der Fähre und lässt Archers Leute zurück. Die Lage wird besonders ernst, als Tucker herausfindet, dass das feindliche Schiff in Kürze auseinander brechen wird ...

Als das größte Heiligtum der Vulkanier, das Kloster von P'Jem, überfallen wird, macht der Botschafter der Vulkanier die Crew der Enterprise dafür verantwortlich und beendet bis auf weiteres die Zusammenarbeit mit der Sternenflotte. Darüber hinaus verlangt er die Absetzung von Captain Archer und holt seine Wissenschaftsoffizierin T'Pol von Bord der Enterprise. Archer, der seinen Posten dank Admiral Forrest behalten darf, ist über diese Entscheidung zutiefst betrübt ...

Aus unerklärlichen Gründen kommt es zu einem versehentlichen Zusammenstoß der Enterprise mit einem Schiff der Tessianer. Die tessianische Crew kann sich gerade noch an Bord der Enterprise retten, bevor ihr Schiff auf einem Asteroiden zerschellt. Zu ähnlichen technischen Problemen kommt es an Bord einer Raumfähre, die gerade von Malcolm und "Trip" getestet wird - Sensoren und Funkgerät fallen durch einen heftigen Stoß aus. Zur Rettung der beiden bleiben nur zehn Tage ...

Die Mannschaft der Enterprise hat einen systemlosen Planeten entdeckt, von dem Signale verschiedener Lebensformen, geologischer Aktivitäten und sogar Energiesignaturen eines Schiffes ausgehen. Als Archer gemeinsam mit T'Pol, Hoshi und Reed auf den Planeten fliegt, um diesen zu erkunden, treffen sie drei Männer vom Volk der Eska, deren Anführer Damrus erklärt, dass sie hier zur Jagd sind. Auf wen Jagd gemacht wird, soll Archer von einer geheimnisvollen Frau erfahren ...

Einzig Tucker bleibt verschont, als die Enterprise von Aliens überfallen und die Crew mit einem Gas betäubt wird. Von seinem Versteck aus kann er beobachten, wie die habgierigen Außerirdischen das Schiff plündern und Pläne schmieden, wie sie die Frauen auf dem Sklavenmarkt verhökern könnten. Als die Aliens Captain Archer aufwecken, um von ihm zu erfahren, wo sich weitere wertvolle Güter an Bord befinden, nutzt Tucker die Chance, auch T'Pol aus ihren Träumen zu reißen ...

Auf ihrer Reise durch das All stößt die Crew der Enterprise auf ein Raumschiff, das vor vielen Jahren auf einen verlassenen Planeten abstürzte und seitdem angeblich von Geistern heimgesucht wird. Als Captain Archer und seine Leute das Wrack durchsuchen, stoßen sie auf eine bewaffnete Gruppe, die sich als Mannschaft des abgestürzten Schiffes herausstellt. Laut ihren Angaben konnte das Schiff mangels Material nicht mehr startklar gemacht werden.

Ein Versehen wird Archer und Travis Mayweather zum Verhängnis: Als die beiden auf einem Erkundungsflug militärisches Sperrgebiet durchfliegen, werden sie von den Tandaranern festgenommen. Obwohl Archer und Travis keine Suliban sind und nichts über deren Kriegerkaste Cabal wissen, werden sie bis zum Tag ihrer Verhandlung eingesperrt. Die Crew der Enterprise, die sich nicht in innere Angelegenheiten einmischen darf, überlegt fieberhaft, wie sie ihren Leuten helfen kann ...

Als eine Gruppe Kreetassianer nach einer ungewollten Beleidigung völlig überstürzt die Enterprise verlässt, gelangt über die Luftschleuse ein rankenartiges Gebilde an Bord des Schiffes. Mit seinen riesigen Tentakeln gelingt es der fremden Lebensform, Rostov, Kelly, Archer und Tucker einzufangen und sein eigenes Nervensystem mit denen seiner Opfer zu verbinden. Jeder Angriff auf das Wesen würde nun das Leben der gefangenen Besatzungsmitglieder gefährden!

Captain Archer soll im Auftrag von Admiral Forrest die vulkanische Botschafterin V'Lar von Mazar abholen und zu einem Schiff ihrer Landsleute bringen. Doch schon kurz nach Beginn der Reise scheint die Mission zu scheitern: Die Enterprise wird mit der Forderung, V'Lar sofort auszuliefern, von einem Mazariten-Schiff angegriffen. Als Archer von seinem Gast die Gründe für diese Attacke wissen will, bleibt die Botschafterin aufgrund ihrer Schweigepflicht als Diplomatin stumm ...

Aus Dank für die Durchführung wichtiger Reparaturen lädt ein gewisser Zobral Archer und Tucker auf seinen Wüstenplaneten ein. Während es sich die beiden bei ihrem Gastgeber gut gehen lassen, findet T'Pol heraus, dass Zobral ein gesuchter Terrorist ist, der Dutzende Anschläge verübt hat ...

Für Archer, Tucker, Reed, Sato und Mayweather geht ein kleiner Traum in Erfüllung, als die Enterprise endlich den Ferien-Planeten Risa erreicht. Die zwei wohlverdienten Ferientage verlaufen allerdings ganz anders als geplant: Während Tucker und Reed in eine Falle intergalaktischer Trickdiebe tappen, wird Archer von den Lügengeschichten der attraktiven tandaranischen Keyla ganz schön auf Trab gehalten. Sato verliert unterdessen ihr Herz an einen Fremden namens Ravis ...

Als ein Shuttle der Enterprise zu einer Kolonie der Paaraganer fliegt, passiert eine Katastrophe: Offenbar trat während des Fluges Plasma aus dem Antrieb des Schiffes, was eine gewaltige Explosion auf dem Planeten zur Folge hat, da dieser von leicht entzündlichem Gas umgeben ist. Alle 3600 Bewohner der Kolonie sterben. Admiral Forrest nimmt den Vorfall sehr ernst und kommt mit seinen Beratern zu dem Schluss, dass die Mission der Enterprise abgebrochen werden muss ...

Mit einem Gläschen Wein stoßen Captain Archer, Tucker und T'Pol auf die mehrjährige Anwesenheit von T'Pol auf der Enterprise an. Während der Feierlichkeiten kommt das Gespräch auf T'Pols Reise nach Carbon Creek in Pennsylvania, wobei nicht ganz klar ist, weshalb sie wirklich dort gewesen ist. Nach einigem Zögern erzählt sie die wahre Geschichte: Sie handelt von ihrer Großmutter, die während eines Fluges durch das All zu einer Notlandung auf der Erde gezwungen wurde ...

Die Enterprise hat schwere Schäden auf einem romulanischen Minenfeld erlitten und muss zwecks Reparaturarbeiten auf einer vollautomatischen Station landen. Während der vom Computer veranschlagten 32 Stunden Arbeitszeit verschwindet plötzlich Mayweather. Captain Archer, T'Pol, und Reed machen sich sofort auf die Suche nach dem Vermissten und klettern zu diesem Zweck in das Innere der Station. Nach Überlistung aller wichtigen Sensoren stoßen sie auf Unfassbares ...

Die Enterprise hat schwere Schäden auf einem romulanischen Minenfeld erlitten und muss zwecks Reparaturarbeiten auf einer vollautomatischen Station landen. Während der vom Computer veranschlagten 32 Arbeitsstunden verschwindet plötzlich Mayweather. Captain Archer, T'Pol und Reed machen sich sofort auf die Suche nach dem Vermissten und klettern in das Innere der Station. Nach Überlistung aller wichtigen Sensoren stoßen sie auf Unfassbares ...

Ausgerechnet die Kreetassen haben einen von der Enterprise dringend benötigten Plasma-Injektor anzubieten. Obwohl Archer dieses Volk versehentlich schon einmal schwer beleidigt hat, wird er eingeladen, die Kreetassen zusammen mit seinem Hund Porthos zu besuchen. Doch da passiert schon die nächste Kränkung: Der Rüde pinkelt an einen Baum, den die Bewohner als kulturellen Schatz ansehen. Eine unangenehme Situation für Archer, die böse Konsequenzen nach sich zieht ...

Archer, Tucker und T'Pol fliegen zu einem fremden Planeten, um sich bei einer Bergbaukolonie Nachschub an Deuterium zu holen. Obwohl dort die Deuteriumvorräte auch recht knapp sind, finden Archer und Tessic, der Anführer der Siedler, eine gemeinsame Lösung, die einen Handel zulässt. Gerade als sich Archer darüber wundert, weshalb die Kolonie trotz ihrer Geschäfte arm geblieben ist, erhält er die Antwort: Räuberische Klingonen stehlen das wertvolle Deuterium!

Vor etlichen Jahren entsandte Vulkan zahlreiche Agenten auf den Planeten der Agoraner, damit sie den Einheimischen im Kampf gegen die Korruption helfen konnten. Nach erfolgreich abgeschlossener Operation weigerten sich einige der Agenten, wieder nach Vulkan zurückzukehren. T'Pol konnte damals alle Deserteure dingfest machen - bis auf Menos. Als der Verbrecher erneut aufgespürt wird, bricht T'Pol zusammen mit Archer und Mayweather auf, um ihre Mission zu beenden ...

Zu Forschungszwecken reisen Archer, Reed und Sato bis zur Unkenntlichkeit getarnt auf einen Planeten, dessen Bewohner sich noch in der Prä-Warp-Phase befinden. Als der Trupp auf die Enterprise zurückkehrt, wird Reed bewusst, dass er seinen Kommunikator auf dem Planeten verloren hat. Aus diesem Grund fliegt er zusammen mit Archer zurück, wo sie jedoch eine böse Überraschung erwartet: Die Einheimischen halten die beiden für Spione, nehmen sie gefangen und foltern sie ...

Seit die Enterprise Kurs auf ein schwarzes Loch genommen hat, gehen bei der Crew die bizarrsten Veränderungen vor: Tucker arbeitet nur noch an Archers Chefsessel, Reed möchte das Sicherheitssystem um jeden Preis verbessern, Sato bemüht sich um die Kreation eines einmaligen Gerichtes und Phlox hält Mayweather auf der Krankenstation fest, weil er sein Gehirn aufschneiden will. Einzig T'Pol ist die Alte und versucht, den merkwürdigen Veränderungen auf den Grund zu gehen ...

Tucker und Sato sind auf einem fremden Planeten gelandet, auf dessen Oberfläche sie antike Ruinen untersuchen sollen. Während ihrer Forschungsarbeiten werden die beiden plötzlich von einem mit polarischer Energie aufgeladenen Sturm überrascht - sie sind gezwungen, sich wieder an Bord der Enterprise beamen zu lassen. Bei diesem Vorgang geht jedoch etwas schief: Sato fühlt sich nach dem Transport nicht ganz wohl und spürt, dass ihre Moleküle in Unordnung geraten sein müssen ...

Die Crew eines retellianischen Frachters nimmt mit der Enterprise Kontakt auf, weil sie Unterst ützung bei der Reparatur diverser Systeme des Schiffes braucht. Als Tucker sich einer der Stasiskammern der Fremden annimmt, weckt er versehentlich die Insassin auf. Schnell stellt sich heraus, dass die Frau eine kriosianische Prinzessin namens Kaitaama ist, die sich keineswegs freiwillig an Bord der Retellianer befindet ...

Gerade als die Enterprise einen neu entdeckten Planeten erkunden will, erfährt die Crew, dass sich eine Wellenfront ihrem Schiff nähert. Da die neutronische Wellenfront sich mit höherer Geschwindigkeit nähert, als die Enterprise fliehen kann, entschließt man sich, die Mannschaft in dem so genannten Catwalk, den am besten abgeschirmten Teil des Schiffes, zu bringen. Es soll sich jedoch schon bald herausstellen, dass der Crew nicht nur von der Wellenfront Gefahr droht ...

Während Tucker ein verbessertes Shuttle testet, wird er plötzlich ohne Vorwarnung von einem fremden Schiff angegriffen. Zwar wird sein Schiff schwer getroffen, doch er und sein unbekannter Gegner können gerade noch auf der Nachtseite des Mondes landen. Die Crew der Enterprise macht sich unverzüglich auf die Suche nach Tucker, da sie etwas weiß, was ihm und seinem Gegner nicht bewusst ist: Bei Tagesanbruch erwärmt sich die Mondoberfläche auf ein tödliches Niveau ...

Phlox benötigt von einer Gruppe vulkanischer Ärzte dringend Informationen über das Pa'nar-Syndrom, an dem T'Pol erkrankt ist und das bei Nichtbehandlung tödlich verläuft. Allerdings sind alle am Pa'nar-Syndrom Leidenden in der vulkanischen Gesellschaft geächtet, sodass Phlox den Ärzten nicht verraten darf, dass T'Pol an der Krankheit leidet. Doch die Vulkanier kommen dennoch hinter das Geheimnis ...

Captain Archer wird von seinem alten Freund Shran gebeten, den Andorianern zu helfen, einen Streit mit den Vulkaniern um einen strategisch g ünstig liegenden Planeten zu schlichten. Nachdem erste Gespräche erfolglos verlaufen sind, fliegt Archer zusammen mit dem Botschafter Soval und T'Pol zu seinem Freund. Gerade als das Shuttle landen soll, wird es plötzlich beschossen und stürzt ab. Zwar bleiben alle drei unverletzt, doch schon kurz darauf geraten sie unter Beschuss ...

Archer und Tucker werden auf einem ihrer Fl üge irrtümlich verhaftet und wegen vermeintlichen Schmuggels auf ein enolianisches Gefängnisschiff gebracht, dessen Ziel die Strafkolonie Canamar ist. Während die Crew versucht, das Missverständnis so schnell wie möglich aufzuklären und die Kollegen zu befreien, gelingt es dem Strafgefangenen Kuroda eine Revolte anzuzetteln und das Schiff in seine Gewalt zu bringen ...

Während ihrer Reise durch das All treffen Archer und seine Crew auf ein enormes Schiff, das die Enterprise in einen Hangar in seinem Inneren befördert. Dort hat die Mannschaft schon bald einen ersten Kontakt mit den anderen Crewmitgliedern, die sich als körperlose Lebewesen erweisen. Als die wolkenähnlichen Geschöpfe zu Forschungszwecken plötzlich ungefragt in immer mehr Körper von Archers Leuten dringen, wird der Captain langsam misstrauisch ...

Captain Archer steht als Angeklagter vor einem klingonischen Tribunal. Er wird beschuldigt, einer Gruppe von Rebellen auf seinem Schiff Unterschlupf gewährt und obendrein eine Rebellion geschürt zu haben. Seine einzige Hoffnung, der Todesstrafe oder einem Leben in den Dilithiumminen von Rura Penthe zu entkommen, ist Kolos, ein alternder und desillusionierter klingonischer Anwalt, der nur wenig Energie und Enthusiasmus für seinen Fall aufbringt.

Während die Crew der Enterprise zwei Gasriesen beobachtet, hat Mayweather Urlaub genommen, um zur Horizon, dem Schiff seiner Familie, zu fliegen und seine Verwandten zu besuchen. Sein Bruder Paul, der nach dem Tod des Vaters zum neuen Captain geworden ist, ist auf Mayweather nicht gerade gut zu sprechen - vor allem nicht, als dieser ungefragt einige Upgrades an der Horizon vornimmt. Erst als die Horizon von einem fremden Schiff angegriffen wird, halten die Brüder zusammen ...

Während Trip, Reed und Mayweather drei denobulanische Geologen wegen einer Verordnung der neuen Regierung auf dem Planeten Xantoras abholen sollen, kümmert man sich an Bord der Enterprise um den schwer verletzten Antaraner Hudak. Der Patient will sich nicht von dem denobulanischen Dr. Phlox behandeln lassen, weil dessen Volk seit einem Krieg von 300 Jahren Erzfeind der Antaraner ist. Der Hass sitzt so tief, dass Hudak eher sterben möchte, als von Phlox untersucht zu werden ...

Bei der Beobachtung eines Hypergiganten trifft die Enterprise auf ein vissianisches Schiff. Archer begleitet die technisch höher entwickelten Vissianer auf einem Flug in die Photosphäre des Giganten, während Trip den vissianischen Ingenieur und dessen Frau zum Essen einlädt. Dabei lernt er den Co-Erzeuger kennen, ein dreigeschlechtliches Wesen, dessen einzige Aufgabe darin besteht, bei der Baby-Produktion behilflich zu sein ...

Am Polarkreis findet ein Forscherteam Trümmer eines Raumschiffes und mehrere tiefgefrorene Körper unbekannter Spezies. Bei der Untersuchung erwacht eine der vermeintlichen Leichen und überwältigt die drei Wissenschaftler. Mit dem Auftrag, das Schiff zu finden, in dem die einst Tiefgefrorenen mit ihren Geiseln fliehen konnten, folgt die Enterprise einem Notruf. Als sie einige verletzte Tarkaleaner an Bord nehmen, wird Dr. Phlox angegriffen und mit Nano-Sonden infiziert ...

Auf dem Weg zu einem dunklen Materie-Nebel erzählt Archer T'Pol von seinem Freund Robinson, der kurz zuvor beim Bergsteigen tödlich verunglückt ist. Robinson wurde damals für den ersten Warp-2-Flug ausgewählt, doch der Versuch misslang. Die Vulkanier überzeugten daraufhin die Sternenflotte, das Programm einzustellen. Doch Trip, Archer und Robinson waren vom Erfolg eines weiteren Versuchs überzeugt. Trotz des Verbots starteten sie einen unangemeldeten Flug ...

Mit seiner freundlichen und umgänglichen Art überzeugt Skalaar Captain Archer, ihn auf der Enterprise zu treffen. Plötzlich schlägt er jedoch Trip nieder und entführt Archer. Nachdem sein altes Schiff, die Tezra, beschlagnahmt wurde, benötigt Skalaar dringend Geld, um es zurückzukaufen. Und die Klingonen haben auf Archer ein nicht unerhebliches Kopfgeld ausgesetzt - doch die Enterprise nimmt die Verfolgung auf ...

Bei einem Angriff auf die Erde kommen etwa sieben Millionen Menschen ums Leben. Die Xindi, eine bisher unbekannte Rasse, ziehen dabei mit einer Art Laserstrahl eine tiefe Furche von Florida bis Venezuela. Archer erfährt von einem humanoiden Wesen, das angeblich aus der Zukunft stammt, dass die Xindi die Erde angreifen, um nicht in 400 Jahren von den Menschen vernichtet zu werden. Daraufhin versucht er, den Sachverhalt mit den Xindi zu klären ...

Um die Xindi finden und mit ihnen verhandeln zu können, benötigt Archer die Koordinaten ihres Heimatplaneten. Ein Vorarbeiter behauptet, einen Xindi unter seinen Minenarbeitern zu haben - doch für ein Gespräch verlangt er einen halben Liter flüssiges Platin. Nach zähen Verhandlungen kommt es zu einem Treffen zwischen Archer und Kessick, dem Xindi. Der fordert als Gegenleistung für die Koordinaten die Befreiung aus seinem Gefängnis ...

Aufgrund der Anomalien in der Ausdehnung bricht an Bord der Enterprise Chaos aus. Da nähert sich ein unbekanntes Schiff, das führungslos im All treibt. Gemeinsam mit McKenzie, Hawkins und Romero betritt Archer das fremde Schiff. Bei der Untersuchung finden sie 17 Leichen - gestorben, weil die Lebenserhaltung ausfiel. Außerdem gibt es deutliche Anzeichen einer Plünderung. Plötzlich taucht ein weiteres Schiff auf und Fremde beamen auf die Enterprise ...

Archer ist es gelungen, den Kurs der Xindi zu rekonstruieren. Er fliegt zum letzten Planeten, den sie besucht haben. Als sich T'Pol, Archer, Reed und Hoshi auf die Oberfläche begeben, finden sie dort eine Landefähre und mehrere Leichen. Doch plötzlich beginnen sich Hoshi, Archer und Reed zu verändern - sowohl im Aussehen als auch in ihren Verhaltensweisen. T'Pol kann gerade noch einen Notruf an die Enterprise senden, dann bricht der Kontakt ab ...

Die Xindi bauen weiter an ihrer Biowaffe, sie benötigen jedoch weitere Informationen über die Menschen. Archer sucht inzwischen einen Chemiker namens B'Rat Ud auf. Neben dem Rezept zur Synthetisierung von Trellium-D gibt der Archer einen Hinweis - der Sklavenhändler Zjod weiß angeblich mehr über die Xindi. Als Archer, Trip und Reed Zjod einen Besuch abstatten, bittet eine seiner Sklavinnen Archer um Hilfe. Doch die Frau versucht, die Crew zu manipulieren ...

Ein Notruf des vulkanischen Schiffes "Seleya" erreicht die Enterprise. Archer, Reed, T'Pol und Hawkins suchen in dem schwer beschädigten Schiff nach Überlebenden. Trotz eindeutiger Biozeichen können sie zunächst niemanden finden. Doch plötzlich werden sie von den gesuchten Vulkaniern angegriffen - allerdings haben diese sich stark verändert. Und auch T'Pol beginnt, sich merkwürdig zu verhalten ...

In Hoshis Quartier taucht plötzlich ein Fremder auf und spricht mit ihr. Doch sämtliche Untersuchungen ergeben keinerlei Hinweise auf einen Eindringling. T'Pol findet heraus, dass es sich bei der Erscheinung um eine zweite Sphäre handeln muss. Der Fremde lebt auf einem drei Lichtjahre entfernten Planeten und möchte Hoshi gern treffen - dafür bietet er ihr wichtige Informationen über die Xindi an. Archer und Reed begleiten Hoshi zu dem Treffen ...

Die Enterprise hat den Planeten erreicht, auf dem ein Teil der Waffe der Xindi gebaut wird. Die Überprüfung einer Art radiolytischer Verbindung ergibt einen eindeutigen Hinweis zu der Sonde, welche die Erde angegriffen hat. Archer überrascht den Cheftechniker Gralik in dessen Behausung. Offenbar lassen die Xindi Gralik ein Material produzieren, das sie für den Bau der Waffe benötigen - doch Gralik weiß nichts davon ...

Archer infiziert sich mit Parasiten, die ihn alles vergessen lassen, was nach der Infektion geschieht. Das Kommando über die Enterprise wird ihm entzogen. Zwölf Jahre später - inzwischen lebt Archer mit T'Pol auf einem Planeten und Trip kommandiert die Enterprise - verkündet Phlox, dass er ein Heilmittel gefunden habe. Archer muss bei einer Subraum-Implosion vaporisiert werden. Ein Test auf der Enterprise verläuft erfolgreich, doch dann greifen Xindi-Schiffe an ...

Die Enterprise entdeckt auf einem Planeten menschliche Siedlungen wie im Wilden Westen. Da die Gebäude etwa 250 Jahre alt sind, versucht Archer herauszufinden, wie diese Menschen auf den Planeten gelangt sind. Eine fremde Rasse, die Skags, wird von den Einwohnern unterdrückt und als Sklaven gehalten. Archer freundet sich mit einer Lehrerin an, die sie trotzdem heimlich unterrichtet - was höchst illegal ist. Als sie der Deputy erwischt, werden sie verhaftet ...

Nach einer Antriebs-Modifikation kann die Enterprise mit Warp 4,9 fliegen, bei einem Testflug gerät sie jedoch in ein polarisches Feld und wird vollkommen lahm gelegt. Trip wird dabei schwer verletzt und fällt ins Koma. Um seinen Tod zu verhindern, versucht Phlox mit Hilfe einer lyssarianischen Wüstenlarve einen Klon von Trip zu erschaffen. Mit einer Lebensspanne von nur 15 Tagen soll er das Nervengewebe für eine Transplantation liefern ...

Archer erfährt von Daniels, dem Mann aus der Zukunft, dass vor 150 Jahren drei Xindi-Reptilianer auf der Erde entdeckt wurden. Daraufhin reisen Archer und T'Pol ins Jahr 2004 und begeben sich auf die Suche. Ein Mann namens Loomis, der einen Menschen im Rollstuhl in ein verlassenes Fabrikgebäude bringt, erweckt dabei ihre Aufmerksamkeit. Unter Druck gesteht er, dass er den Xindi einen Menschen jeder Blutgruppe bringen soll ...

Die Enterprise nimmt die Besatzung eines in Not geratenen Schiffes an Bord. Dann zeigt sich jedoch schnell, dass D'Jamat, der Anführer der Fremden, in Wirklichkeit nur die Absicht hatte, die Enterprise zu übernehmen. Er postiert an allen wichtigen Stationen mit Sprengstoff versehene Männer und lässt zur Demonstration einen von ihnen Selbstmord begehen - dabei stirbt auch ein Mitglied der Enterprise-Crew. Captain Archer hat keine Wahl, er übergibt D'Jamat sein Schiff ...

Durch ein aufgefangenes Signal kann die Enterprise der Xindi-Waffe folgen. Dafür müssen sie jedoch durch ein dichtes Anomalienfeld fliegen, und ausgerechnet in dieser Situation versagt die Steuerung. Das Schicksal der Enterprise scheint besiegelt, als in letzter Sekunde ein andorianisches Schiff zur Rettung eilt und sie mit seinem Traktorstrahl aus der Gefahrenzone zieht. Nach zahlreichen Reparaturen machen sich beide Schiffe gemeinsam auf die Suche nach der Waffe ...

Der Enterprise-Crew ist es gelungen, ein Xindi-Schiff abzufangen. Um an Informationen über den Aufenthaltsort der Xindi-Waffe zu kommen, manipuliert Archer das Gedächtnis des Gefangenen Degra und bringt ihn in einen Simulator. Dann spielt er ihm vor, dass sie drei Jahre gemeinsam im Gefängnis gesessen hätten, aus dem sie gerade geflohen sind. Degra verrät die Koordinaten eines roten Riesen, aber dann wird er wegen einer Fehlfunktion des Simulators misstrauisch ...

Amanda, die der neuen Sicherheitstruppe an Bord angehört, versteht sich sehr gut mit Trip. Deswegen lässt sie sich von ihm mit einer vulkanischen Neuro-Pressur behandeln. Dabei kommen sich die beiden deutlich näher, und auch die Crew bemerkt schnell ihr intimes Verhalten. Besonders T'Pol interessiert sich plötzlich für die menschliche Sexualität. Währenddessen kommt es zu einem Machtkampf zwischen Hayes, dem Anführer der Maco, und dem Sicherheitschef Reed ...

Unterwegs nach Azati Prime wird die Enterprise von einer Raumstörung aufgehalten, die zu umfliegen Wochen dauern würde. Also beschließt Captain Archer hindurchzufliegen. Doch da die Auswirkungen der Störung den Neo-Kortex beeinträchtigen, muss die gesamte Crew in einen Tiefschlaf versetzt werden. Deswegen übergibt Archer das Schiff in die Obhut von Dr. Phlox, den die Störung nicht beeinträchtigt. Aber kaum schläft die Besatzung, hört Dr. Phlox merkwürdige Geräusche ...

Auf einem Planeten findet die Enterprise-Crew die Überreste eines abgestürzten Xindi-Insektoiden-Schiffes. Captain Archer leitet ein Außenteam, das in einem speziell abgesicherten Raum merkwürdige eierartige Gebilde findet. Aus einem dieser Eier spritzt eine Flüssigkeit auf Archer, doch Dr. Phlox kann keinerlei gesundheitliche Folgen feststellen. Um den Nachwuchs der Xindi am Leben zu erhalten, setzt Archer sogar einen Notruf ab ...

Endlich ist die Enterprise bei Azati Prime eingetroffen. Um unbemerkt auf dem Planeten landen zu können, manipuliert die Crew das Insektoiden-Schiff, das noch an Bord ist. Unter Wasser entdecken Mayweather und Trip eine Station der Xindi, in der die tödliche Waffe gebaut wird. Gerade als Captain Archer eine Selbstmord-Mission plant, um die Station zu vernichten, erscheint ihm Daniels aus der Zukunft. Er erklärt ihm, dass nicht die Menschen eine Bedrohung für die Xindi sind ...

Als der zerstrittene Rat der Xindi die Enterprise vernichten lassen will, greift Degra ein und schickt Captain Archer mit einer Fähre zurück zu seinem Schiff. Während die Reparaturen andauern, nähert sich ein fremdes Schiff, das ebenfalls schwer beschädigt ist. Derweil analysiert Hoshi die Datenbank der Xindi-Fähre und findet eine verschlüsselte Nachricht von Degra mit Koordinaten und einer Sternzeit. Offenbar will sich Degra mit Archer treffen ...

Die Enterprise ist tatsächlich rechtzeitig so weit repariert, dass das Treffen zwischen Captain Archer und Degra stattfinden kann. Archer legt ihm Beweise vor, dass die Reptilianer die anderen Xindi-Spezies hintergehen. Um sich vor der Vernichtung zu schützen, sollten die Menschen und die Xindi zusammenarbeiten. Degra lässt sich überzeugen und glaubt ihm. Da taucht plötzlich ein Schiff der Reptilianer auf und greift die Enterprise an ...

Captain Archer führt die Enterprise in einen Nebel zu einem Subraum-Korridor, durch den er zum Rat der Xindi gelangen will - doch dort treffen sie auf eine weitere Enterprise. Ihr Captain, der sich als Sohn von T'Pol und Trip vorstellt, warnt sie davor, in den Korridor zu fliegen, da sie dadurch 117 Jahre in die Vergangenheit zurückgeschleudert würden. Aber Archer kann die Crew der anderen Enterprise überzeugen, gemeinsam in den Korridor zu fliegen ...

Gemeinsam mit Degra kämpft Captain Archer vor dem Rat der Xindi, um den Einsatz der Waffe gegen die Erde zu verhindern. Mit einer Raumfähre haben T'Pol, Reed, Mayweather und Hawkins zuvor in einer Sphäre Daten gesammelt, die seine Argumentation unterstützen sollen. Der Start der Waffe wird auch tatsächlich zunächst verschoben, aber dann greift der Reptilianer Degra an und ersticht ihn. Durch den Mord aufgebracht, wendet sich der Rat erneut gegen die Menschen ...

Hoshi wurde von den Reptilianern entführt! Sie soll den Startcode der Aquarianer entschlüsseln, aber sabotiert das Vorhaben, wo sie nur kann. Um sie gefügig zu machen, injizieren die Entführer ihr Parasiten, aber Hayes ist bereits auf dem reptilianischen Schiff, um sie zu retten. Währenddessen erklären sich die Aquarianer endlich zur Zusammenarbeit mit den Menschen bereit, allerdings nur unter der Bedingung, dass die Sphären vernichtet werden.

Die einzige Chance, an die Xindi-Waffe heranzukommen, um sie endgültig zu zerstören, ist von innen. Da die Sphären-Bauern eine Störung um die Waffe erzeugt haben, kann die Enterprise aber nicht gefahrlos hineinfliegen. Schließlich können Archer, Hoshi, Reed und zwei andere Crew-Mitglieder hinüberbeamen. Mayweather gelingt es derweil, das Sphären-Netzwerk zu zerstören. Archer legt die letzten Sprengladungen und befiehlt den anderen, das Schiff sofort zu verlassen ...

Im Orbit der Erde stellt die Enterprise-Crew fest, dass sie 200 Jahre in die Vergangenheit gereist ist. Allerdings ist die Geschichte manipuliert: Die Nazis haben im Zweiten Weltkrieg New York besetzt. Doch nicht nur die Enterprise ist in der falschen Zeit gelandet ...

Archer vereinbart mit Vosk die Übergabe von Mayweather und Trip, die Gefangene der Deutschen sind. Im Austausch möchte Vosk sämtliche Ressourcen der Enterprise, um einen Kanal in seine Zeit zu bauen. Captain Archer stellt fest, dass der gefangene Trip sich immer noch in den Händen der Deutschen befindet, da Vosk ihm Silik ausgeliefert hat. Zusammen mit einer Widerstandstruppe macht er sich auf, Trip aus dem Lager zu befreien ...

Die Enterprise kehrt auf die Erde zurück, und die Crew wird überall gefeiert. Auch Captain Archer wird für seine Verdienste geehrt und trifft dabei seine alte Liebe Erika wieder, die mittlerweile selbst Captain ist. Doch die vergangenen Ereignisse lassen Archer nicht los: Der vulkanische Botschafter lastet ihm an, dass die Crew der Seleya gestorben ist. Bei einer Befragung über diese Vorkommnisse rastet er aus und wird deshalb in den Urlaub geschickt

Die Augments, ein von Dr. Soong erschaffenes Volk, kapern ein klingonisches Schiff und töten die Besatzung. Soong, der mittlerweile im Gefängnis sitzt, erklärt sich bereit, der Enterprise bei der Suche nach den Augments zu helfen. Auf ihrer Reise wird die Enterprise von Orions angegriffen. Die entführen einige der Crewmitglieder und verkaufen sie als Sklaven. Captain Archer macht sich mit Soong auf, seine Crew aus den Händen der Orions zu befreien ...

Soong und seine Kinder, die Augments, nehmen Cold Station 12 ein. Dort wollen sie die restlichen Embryonen stehlen, um ihre Familie zu vergrößern. Captain Archer versucht, das mit Hilfe von Phlox zu verhindern, doch beide werden von Soong gefangen genommen. Zusammen mit seinen Kindern und den restlichen Embryonen flieht Soong von Cold Station 12 - nicht ohne vorher einen tödlichen Virus freizulassen, der in kürzester Zeit sämtliches Leben vernichten kann ...

Der Wissenschaftler Soong möchte auf einem abgelegenen Planeten die von Cold Station 12 gestohlenen Embryonen genetisch verändern und aufziehen - doch Malik, eines seiner Kinder, lehnt sich dagegen auf und setzt Soong als Anführer ab. Malik verfolgt von nun an seine eigenen grausamen Pläne: Er möchte einen Krieg zwischen Menschen und Klingonen anzetteln, indem er einen ganzen Planeten verseucht und es den Menschen in die Schuhe schiebt ...

Auf die Botschaft der Erde auf Vulkan wird ein Anschlag verübt, bei dem Admiral Forrest ums Leben kommt. Soval kommt an Bord der Enterprise und bringt V'Las, den Chef des Oberkommandos, sowie Stel, den Chefermittler des Sicherheitsdirektorats, mit. Die beiden Vulkanier verdächtigen die Andorianer, den Anschlag verübt zu haben, um einen Konflikt zwischen der Erde und Vulkan zu provozieren. Archer wird daraufhin von V'Las beauftragt, die Sache zu untersuchen ...

Archer und T'Pol finden nach einer gefährlichen Wanderung durch eine vulkanische Wüste die Syrranniten, die beschuldigt werden, die Botschaft der Erde auf Vulkan gesprengt zu haben. Die Syrranniten behaupten jedoch, dass sie die wahren Lehren von Surak - dem Vater der vulkanischen Philosophie - verfolgen würden. Zu dieser Gruppe gehören auch T'Pau - die Hauptverdächtige für die Anschläge auf die irdische Botschaft - sowie T'Pols Mutter T'Les ...

V'Las ist entschlossen, die Andorianer anzugreifen, um einem Angriff der imperialen Garde zuvorzukommen - Kuvak ist skeptisch. Archer hat indessen ein altes Artefakt in einem Wüstenversteck der Syrranniten gefunden. Es handelt sich um die so genannte Kir'Shara mit den Originalschriften von Surak, dem Vater der vulkanischen Logik. Archer macht sich zusammen mit T'Pol und T'Pau auf den Weg, die Kir'Shara in die vulkanische Hauptstadt zu bringen, um so einen Krieg zu verhindern ...

Emory Erickson, der Vater des Transporters, kommt mit seiner Tochter Danica an Bord. Er plant, ein Experiment mit einem neuen Transporter durchzuführen. Im Zuge der Vorbereitung bemerkt Trip, dass irgendetwas faul ist: Die Aufgaben, die ihm Emory überträgt, sind eigentlich völlig unnötig. Archer setzt ihm die Pistole auf die Brust und erfährt, dass Emory seinen Sohn Quinn, der in dieser Region beim Test eines Transporters verschwunden ist, zurückholen möchte ...

Zwei fremde körperlose Wesen sind in Reed und Mayweather geschlüpft, um die Menschheit zu beobachten. Hoshi und Trip kehren indes von einem Planeten zurück - Trip hat sich mit einem Virus infiziert. Die beiden kommen sofort in die Dekontaminationskammer. Es stellt sich heraus, dass die fremden Wesen die Reaktion der Mannschaft auf das neuartige Virus beobachten. Bald kann Phlox das Virus identifizieren, doch er findet keine Möglichkeit, Hoshi und Trip zu retten ...

Shrans Schiff wird angegriffen und die Crew daraufhin von der Enterprise aufgelesen. Shran berichtet, dass er von Tellariten attackiert wurde. Archer, der den tellaritischen Botschafter Gral zu einem neutralen Planeten namens Babel befördern soll, ist skeptisch. Er soll auf Babel einen Handelsstreit zwischen den Tellariten und den Andorianern zu schlichten versuchen. Als die Enterprise von einem andorianischen Schiff angegriffen wird, glaubt Archer, dass etwas faul ist ...

Trip und Reed befinden sich immer noch in der feindlichen Drohne. Die unbekannten Feinde, möglicherweise Romulaner, wollen scheinbar einen Krieg zwischen den Andorianern und den Tellariten provozieren. Archer versucht, eine Allianz zwischen den beiden Völkern zu bilden, um diese Verbrecher zu finden und einen Krieg zu verhindern. Bei einem Kampf mit Shran gelingt es ihm, diesen zu überwältigen. Aber statt ihn zu töten, schlägt er ihm lediglich einen Teil einer Antenne ab ...

Die Crew findet mit Hilfe der Daten, die Reed und Tucker an Bord der ferngesteuerten Drohne gesammelt haben, heraus, dass das Schiff von der Ferne durch das Gehirn des Piloten gesteuert wird. Shran lässt die Daten von Wissenschaftlern auf Andoria untersuchen und bekommt die Bestätigung, dass die Gehirnwellenmuster von einem Aenar, einer Unter-Spezies der Andorianer, stammt. Archer und Shran begeben sich daraufhin auf die Oberfläche von Andoria, um die Aenar aufzusuchen.

Trip hat sich auf die Columbia versetzen lassen und versieht dort unter Captain Hernandez seinen Dienst. Phlox wird indes von Fremden von der Enterprise entführt. Die Entführer bitten ihn, ein Virus zu untersuchen, das ihre Rasse tötet. Die Fremden erweisen sich als Klingonen, die unter Führung von General K'Vagh und dem Arzt Antaak alles tun, um dieses Virus zu bekämpfen. Phlox stellt fest, dass Spuren der DNA von Augments zu finden sind ...

Bei der Entführung von Phlox haben die Klingonen die Subroutinen der Enterprise manipuliert, sodass Trip von der Columbia zurück auf die Enterprise beordert wird, um die Reparaturen vorzunehmen. Sein Transfer geschieht bei einem riskanten Manöver bei Warpgeschwindigkeit. Mit einem weiteren gewagten Trick repariert Trip die Subroutinen und die Enterprise kann wieder selbstständig normal fliegen. Phlox weigert sich indes weiterhin, klingonische Augments zu erzeugen ...

Auf dem Weg in das Berengarius-System trifft die Enterprise auf ein Schiff der Orion. Dessen Captain Harrad-Sar möchte einiges mit Captain Archer besprechen. Archer hofft, eine Art Frieden mit den Orion schließen zu können und bittet Harrad-Sar auf sein Schiff. Als Gastgeschenk bringt der drei reizende Frauen mit, die einen Tanz vorführen und sich auch sonst als sehr anhänglich erweisen. Da die drei offenbar Sklavinnen sind, gewährt ihnen Archer Asyl auf der Enterprise ...

Im Spiegeluniversum hat die Menschheit die meisten der benachbarten Spezies unterjocht und verfügt bereits über eine beachtliche Flotte. Dem so genannten terranischen Imperium droht dennoch der Fall, denn die Rebellen machen es den Besetzern mehr als schwer. Die Enterprise unter dem Kommando von Captain Forrest soll sich mit der Flotte treffen, um eine Rebellion niederzuschlagen, als der erste Offizier Archer eine Meuterei anzettelt

Archer hat das Kommando auf der Defiant übernommen. T'Pol, die an der Rebellion beteiligt war, arbeitet heimlich weiter gegen Archer und dessen Pläne. Hoshi stellt indes fest, dass das Reich im Parallel-Universum nicht existiert, sondern lediglich eine Föderation der Planeten. T'Pol und Soval, die sich mittlerweile verbündet haben, versuchen mit allen Mitteln, Archer zu stoppen, doch dem gelingt es, Sovals Schiff kampfunfähig zu schießen ...

Auf der Erde findet einen Konferenz über die Zusammenarbeit der verschiedenen Planeten statt. Jedoch gibt es eine terroristische Gruppe namens "Terra Prime", welche von John Frederick Paxton angeführt wird. Deren Mitglieder wollen jeglichen Kontakt zu außerirdischen Spezies stoppen und alle Fremden von der Erde vertreiben, sodass die Menschheit wieder die Erde für sich hat. Inzwischen finden T'Pol und Trip heraus, dass sie eine Tochter haben - jedoch war T'Pol nie schwanger ...

Paxton hat T'Pols und Trips Kind entführt, weil er verhindern will, dass der Säugling die menschliche Rasse für immer verseucht. Seine Organisation Terra Prime stellt ein Ultimatum, dass alle Nicht-Menschen innerhalb von 24 Stunden das Sonnensystem zu verlassen haben. Um seiner Drohung Nachdruck zu verleihen, droht er, die Zentrale der Sternenflotte zu zerstören. Archer und seine Crew nehmen die Verfolgung auf, auch um Trip und T'Pol aus Paxtons Händen zu befreien ...

Riker hat psychische Probleme und erhält von Troi den Rat, sich Aufzeichnungen von den Missionen der ersten Enterprise anzusehen. Auf dem Holo-Deck sieht er, wie die Enterprise zur Erde zurückkehrt, zuvor jedoch einen Abstecher macht, um Shrans Tochter aus den Händen von Außerirdischen zu befreien. Riker versetzt sich in das Programm und spielt den Koch, bei dem sich alle Besatzungsmitglieder ihre Sorgen von der Seele reden ...