Steven Gordon, von seinem verstorbenen Vater liebevoll Flash genannt, trifft bei einem Marathonlauf auf seine Ex-Freundin Dale Arden. Diese ist mittlerweile Reporterin beim Fernsehen und verlobt mit einem Polizisten Namens Joe. Insgeheim fühlt sie sich aber immer noch zu Flash hingezogen. Eines Tages passiert etwas Seltsames. Ming, Herrscher des Planeten Mongo öffnet mit Hilfe eines so genannten Portalgenerators einen Spalt in den Dimensionen und schickt eine Sonde auf die Erde um diese auszuspionieren. Nachdem die Sonde zerstört wurde, schickt er einen Roboter, der ein Gerät namens Imex finden soll, dass von Flashs Vater entwickelt wurde. Um es an sich zu bringen ergreift der Roboter Besitz von Flashs Mutter. Währenddessen lernt Flash mehr oder minder unfreiwillig den Ex-Assistenten seines Vaters kennen, einen gewissen Dr. Hans Zarkov. Er und Dale helfen Flash dabei, den Roboter zu besiegen. Flash findet in seinen Überresten den Führerschein seines Vaters und ein Gerät, das sich als ein Portalschlüssel entpuppt. Somit ist für Flash klar, dass sein Vater noch lebt und er unbedingt nach Mongo muss, um ihn zu finden. Gemeinsam mit Dale springt er durch das Portal und landen auf dem Planeten Mongo, der von dem mächtigen Imperator Ming beherrscht wird. Nach einem heftigen Streit wird Flash von Rankol, Mings rechter Hand gefoltert. Dieser will von Flash wissen, wo sich das Imex befindet, doch Flash weiß es nicht. Flash wird von einem fremden Mädchen befreit, die sich erst später als Mings Tochter Aura entpuppt. Dale hat ganz andere Sorgen, sie soll die Nacht mit Ming verbringen. Doch auch ihr gelingt es zu entwischen. Nach einer gefährlichen Flucht aus Nascent City gehen die drei durch ein Portal zurück auf die Erde. Aura hat das Ganze aber nur inszeniert, weil sie ihrerseits an das Imex kommen will, um ihrem Vater zu beweisen, dass sie mehr sein kann als nur seine kleine Tochter. Flash findet heraus, dass das Imex nichts anderes ist, als eine Armbanduhr seines Vaters, die einen Mikrochip mit wichtigen Daten enthält. Ming, immer noch besessen davon das Imex zu bekommen, schickt eine Kopfgeldjägerin namens Baylin auf die Erde. Sie soll das Imex für ihn besorgen und auch seine Tochter zurückbringen. Durch einen geschickten Schachzug zerstört Flash eine andere Uhr und lässt Aura so glauben, dass er das Imex zerstört hat. Aura gelingt nach einem heftigen Kampf die Flucht nach Mongo. Baylin hat weniger Glück; sie schafft es nicht durch das sich schließende Portal nach Mongo zu gelangen und muss fortan auf der Erde bleiben.

Während Zarkov versucht einen defekten Portalschlüssel zu reparieren, mit dem es möglich ist bereits bestehende Portale zu öffnen, entdeckt ein Parkaufseher eine mysteriöse Frau, die sich angeblich 'unsichtbar' machen kann. Es handelt sich um die Kopfgeldjägerin Baylin, die von Ming auf die Erde geschickt wurde. Da sie ohne den Portalschlüssel nicht mehr nach Mongo zurückkehren kann, schickt Ming ihren Bundpartner Tyrus zur Erde. Dale will auf jeden Fall verhindern, dass genaue Informationen über diesen Vorfall in die Öffentlichkeit geraten. In der Zwischenzeit sucht Baylin Zuflucht im Haus von Flash Gordon, doch Tyrus findet sie dort und will sie wieder nach Mongo zurückbringen. In letzter Sekunde gelingt es Flash, Tyrus im Kampf in ein instabiles Portal zu stoßen und Baylin zu retten.

Flash und Dale kleiden Baylin neu ein, da sie gemeinsam zu einer Hochzeitsfeier gehen wollen. Als sie sich zusammen mit Nick, dem Bruder des Bräutigams, auf den Weg zur Feier machen, meldet Zarkov ein neues Portal, das Flash sich etwas genauer ansehen soll. Nachdem sie es gefunden haben, werden sie von einem Schwarm Glückswespen angegriffen - und unglücklicherweise wird Nick von einem der Insekten gestochen. Baylin weiß, dass der Stich der Glückswespe bei ihrem Opfer extreme Euphorie auslöst und schließlich zum Tode führt. Dieses Schicksal kann nur ein Heiltrank abwenden, dessen Rezept vom Stamm der Omadiranen auf Mongo gehütet wird. Während Dale mit Nick zur Hochzeitsfeier fährt und alles daran setzt, dem Infizierten so viele Stressmomente wie nur möglich zu verschaffen, damit die Wirkung des Gifts sich verlangsamt, reisen Flash und Baylin nach Mongo. Flash schlägt den Omadiranen einen Handel vor: Wenn sie ihm den Heiltrank geben, bekommen sie dafür die Urne der Omadria, ein heiliges Artefakt, das ihnen Baylin auf Mings Befehl hin gestohlen hat. Um die begehrte Urne zu entwenden, wagen sich Flash und Baylin in die Höhle des Löwen: Verkleidet schleichen sie sich in Mings Zitadelle...

Wieder hat sich ein Portal geöffnet. Als Flash, Dale, Baylin und Zarkov die Videoaufzeichnung der Überwachungskamera sehen, stellen sie erstaunt fest, dass Flashs Vater durch das Portal auf die Erde zurückgekehrt ist. Wenig später berichtet Joe von einem Autodiebstahl, den, nach einem Phantombild zu urteilen, Mister Gordon begangen haben soll. Gordon sucht in Washington Dr. Martin Landry auf, einen wissenschaftlichen Kollegen von damals, um ihn zu manipulieren. Als Flash und Baylin bei Phazer Laboratories Nachforschungen anstellen, ist Dr. Landry bereits ums Leben gekommen. Die beiden finden heraus, dass eine gewisse Dr. Mary Hiller damals ebenfalls zum wissenschaftlichen Team von Dr. Gordon gehörte. Flash und Baylin beschließen, die Wissenschaftlerin aufzusuchen, um ihr einige Fragen zu stellen. Dort kommt es zu einer Schießerei zwischen Flash und Dr. Gordon, dem mit dem 'abgesaugten' Gehirn von Dr. Hiller die Flucht gelingt. Hinter dem Plan steckt Ming, der mit Hilfe der abgesaugten Gehirne der beiden Wissenschaftler ein Monopol der Portaltechnologie erschaffen will. Als sie den 'abzapfenden Patrioten' verfolgen, taucht plötzlich ein Doppelgänger von Flash auf. Doch Flash, Baylin, Dale und Zarkov gelingt es, den Patrioten zu überwältigen und auszuschalten...

Flashs Mutter besucht ihren Sohn und lernt Baylin kennen, die sie für seine neue Freundin hält. Inzwischen braut sich auf Mongo neues Unheil zusammen: Vultan, der Anführer des räuberischen Stammes des Daktylen, stiehlt einen Portalschlüssel von Mings Tochter Aura und öffnet ein Portal zur Erde. Dort entführen Daktylen und seine Männer einen Jungen namens Tee-Jay, der angeblich Rayel heißt und der Sohn Vultans sein soll. Als sie mit ihm nach Mongo zurückkehren, will der Stamm das Initiationsritual für junge Krieger mit dem Jungen durchführen. Allerdings war Aura in der Zwischenzeit nicht untätig - sie hat die Daktylen und Tee-Jay ausfindig gemacht. Doch durch einen Trick gelingt es ihr, den Jungen zu entführen. Aura schlägt Vultan einen Tausch vor: Den Portalschlüssel gegen seinen Sohn. Flash bietet Vultan seine Hilfe an und beide machen sich gemeinsam auf den Weg zu Aura. Aber dort werden sie von Rankol in eine Falle gelockt, der den Portalschlüssel an sich nimmt und Flash, Vultan und seinen Sohn verfolgen lässt...

Nachdem sich in einer Garage ein Portal geöffnet hat, suchen Flash, Zarkov und Baylin nach einem neuen Besucher von Mongo. Diesmal ist es Lilian, die auf der Erde junge Männer mit ihrem speziellen Lockduft in die Falle lockt, um ihnen dann ihre Lebensenergie auszusaugen. Die Opfer altern rapide und sterben kurze Zeit später. Flash und Baylin stoßen unterdessen auf die Leiche eines Soldaten von Ming, der auf Lilian angesetzt wurde. Es gelingt ihnen jedoch, den Leichnam über das Portal zu Ming zurückzuschicken, der wiederum sofort eine weitere Soldatin auf die Jagd nach Lilian ansetzt. Auch Joe gerät in die Fänge von Lilian und verliert seine Lebensenergie. Flash und Dale recherchieren im College, als sie von einem alten Mann angesprochen werden, der den beiden von Lilian erzählt. Wenig später fangen sie Lilian und zwingen sie dazu, Joe seine Lebensenergie zurückzugeben. Joe erinnert sich daraufhin glücklicherweise an nichts und so ist das Geheimnis von Mongo weiterhin gut vor ihm gehütet. Lilian wird überwältigt und von Mings Soldatin nach Mongo gebracht.