Twin Peaks ist eine kleine Stadt im Norden der USA, unweit der kanadischen Grenze. Hier wird eines Morgens die Leiche der 17-jährigen Laura Palmer gefunden, die vor ihrem Tod vergewaltigt und schwer misshandelt wurde. Das Verbrechen reißt den Ort jäh aus seiner Verschlafenheit und scheinbaren Ruhe und konfrontiert seine Einwohner mit den abgründigen Seiten des Lebens. Offensichtlich geht in Twin Peaks einiges vor, was sie bislang nicht wahrhaben wollten ...

In der Mordsache Laura Palmer tappen Sheriff Truman und Dale Cooper weiterhin im Dunkeln. Auf den ersten Blick sieht es so aus, als sei Laura ein ganz normaler und allseits beliebter Teenager gewesen, doch als sie James Hurley verhören, mit dem Laura heimlich liiert war, erfahren sie von einer anderen Seite des hübschen Mädchens: Sie hatte Probleme und nahm Drogen. Lauras Freundin Donna und James wollten ihr helfen, doch offensichtlich hatte Laura auch vor ihnen Geheimnisse ...

Dale Cooper erhält einen Hinweis auf einen Sexclub, in dem auch Benjamin Hornes exzentrischer Bruder Jerry - frisch aus Paris nach Twin Peaks zurückgekehrt - gerne absteigt. "One-Eyed Jacks" ist der Name des Ladens, in dem Cooper recherchiert. Zunächst hält er Leo Johnson für den Hauptverdächtigen im Mordfall Laura Palmer, doch dann hat er einen merkwürdigen Traum, in dem ihm ein einarmiger Mann erscheint - und der gibt ihm einen ganz anderen Fingerzeig ...

Eine zweite Autopsie der Leiche Laura Palmer bestätigt, was Special Agent Cooper schon lange aufgrund seiner Recherchen vermutet hatte: Laura war kokainabhängig. Auf ihrer Beerdigung kommt es deshalb zum großen Eklat, denn Bobby wirft der Trauergemeinde Bigotterie und Heuchelei vor. Viele Bürger von Twin Peaks hatten von Lauras Problemen gewusst, doch niemand hatte versucht, ihr zu helfen. Anschließend greift Bobby James an, den er für Lauras Mörder hält ...

Als Sheriff Truman anhand von Sarah Palmers Beschreibung ein Phantombild von Bob anfertigen lässt, den Sarah in einer Vision gesehen hat, stellt sich heraus, dass dieser Mann genauso aussieht wie der, der Agent Cooper im Traum erschienen ist. Deputy Hawk sucht unterdessen den harmlos wirkenden Einarmigen auf, der einen Tierarzt namens Bob kennt. Sie suchen den Tierarzt auf und beschlagnahmen seine Akten. Zur gleichen Zeit stellt Audrey Horne eigene Recherchen an ...

In der Wohnung von Jacques Renault entdeckt die Polizei ein Magazin mit Kontaktanzeigen - das gleiche Heft, das auch in Laura Palmers Bankschließfach gefunden wurde. In dem Magazin ist ein freizügiges Foto von Laura abgebildet. Wie die Polizei herausfindet, hatte Jacques Renault ein Postfach, an das die Antworten auf die Kontaktanzeigen geschickt wurden. Und noch etwas ist interessant: Auch ein Foto von Leos Laster findet sich in dem Heft. Doch Leo bleibt verschwunden ...

James und Donna, die unabhängig von Agent Cooper auf eigene Faust nach dem Mörder von Laura Palmer suchen, halten den Psychiater Dr. Jacoby für den Täter. Lauras Cousine Madeleine hilft ihnen und findet in Lauras Zimmer Kassetten, die Laura für Jacoby aufgenommen hatte - möglicherweise ein Beweisstück. Unterdessen betreibt auch Audrey, die sich in Dale B. Cooper verknallt hat, eigene Recherchen, um den Agent zu beeindrucken. Und auch sie macht aufregende Entdeckungen ...

In der Wohnung von Dr. Jacoby haben Donna und James eine Kassette mit belastendem Material und eine Kette mit einem halben Herzen gefunden. Unterdessen erfährt Agent Cooper im "One-Eyed Jacks" vom Barkeeper Jacques Renault weitere Details der Mordnacht. So erzählt Renault, dass er sich in der fraglichen Nacht mit Leo Johnson geprügelt hatte und das Bewusstsein dabei verlor. Als der Agent nach der Befragung in sein Hotelzimmer zurückkehrt, wird auf ihn geschossen ...

Als Agent Cooper nach einer Zeugenbefragung ins Hotel zurückkehrt, wird er von einem Unbekannten angeschossen und schwer verletzt. Im Krankenhaus hat er eine Vision des freundlichen Riesen, der ihm bereits im Hotel erschienen ist. Dieser gibt ihm mehrere rätselhafte Hinweise zur Lösung des Falls Laura Palmer. Doch auch ganz reale Informationen erhält Cooper im Krankenhaus: Lucy Moran teilt ihm mit, dass Jacques Renault erdrosselt und Leo Johnson angeschossen wurde ...

Nachdem Ronette Polaski aus dem Koma erwacht ist, zeigen ihr Cooper und Truman ein Phantombild von Bob, der des Mordes an Laura Palmer verdächtigt wird. Ronette reagiert äußerst heftig, was den Verdacht erhärtet, dass er der Täter ist. Unterdessen haben auch Audreys Recherchen, die sie auf eigene Faust anstellt, Erfolg: Sie findet heraus, wem das "One-Eyed Jacks" gehört. Als sie Agent Cooper anrufen will, um es ihm mitzuteilen, wird sie jedoch von ihrer Chefin Blackie gestört ...

Agent Cooper erfährt von Leland Palmer, dass dieser den Mann auf dem Phantombild erkannt hat. Nach Lelands Aussage handelt es sich dabei um Robertson, den Nachbarn seiner Großeltern! Cooper erkennt, dass sich die drei Buchstaben, die bei den Opfern gefunden wurden, alle in Robertsons Namen wiederfinden ... Unter Hypnose soll Dr. Jacoby erkennen, wer Jacques Renault getötet hat. Jacoby sieht in Trance Leland, worauf dieser von Cooper festgenommen wird ...

In einem Verhör mit Sheriff Truman gesteht Leland Palmer den Mord an Jacques Renault - er glaubt, dieser habe seine Tochter umgebracht. Zur gleichen Zeit werden Donna bei einem Abendessen von Harold Smith Einzelheiten aus dem geheimen Tagebuch der ermordeten Laura Palmer vorgelesen. Donna möchte das Buch der Polizei übergeben, doch Smith ist dagegen. Eine weitere mysteriöse Person betritt das Geschehen: der seltsame Mr. Tojamura, Gast in Benjamin Hornes Hotel ...

Audrey, die im "One-Eyed Jacks" gefangen gehalten wird, gelingt es, Agent Cooper eine Nachricht mit dem Hinweis auf ihren Aufenthaltsort zukommen zu lassen. Daraufhin schleicht sich Cooper zusammen mit Sheriff Truman in den ominösen Sex-Club und befreit Audrey. Zur gleichen Zeit versuchen Donna und Madeleine, Laura Palmers geheimes Tagebuch von Harold Smith zu stehlen, in dessen Besitz es sich befindet und der nicht bereit ist, es an Agent Cooper auszuhändigen ...

Madeleine und Donna wollen Laura Palmers Tagebuch der Polizei übergeben, doch Orchideenzüchter Smith ist dagegen. Als er wutentbrannt auf die beiden Mädchen losgehen will, taucht James gerade noch rechtzeitig auf und kann sie vor ihm retten. Unterdessen erfüllt sich die dritte Prophezeiung des Riesen: Als die Polizei dem einarmigen Philip Gerard seine Medikamente gegen Schizophrenie entzieht, offenbart sich in ihm der Geist Mike, der wiederum auf den Dämon Bob verweist ...

Nach dem Selbstmord von Harold Smith entdeckt die Polizei im Haus des Toten Laura Palmers geheimes Tagebuch, ein wichtiges Indiz für die Beweisführung von Agent Cooper. Er findet darin Hinweise auf Lauras Vater und auf Benjamin Horne. Auch Audrey Horne hat inzwischen einiges Verdächtige über ihren Vater herausgefunden, und so lässt Cooper Benjamin Horne vorläufig festnehmen. Als Cooper am Abend mit Sheriff Truman im "Roadhouse" ist, erscheint ihm erneut der Riese ...

Als Donna und James sich von Madeleine Ferguson verabschieden wollen - die Twin Peaks verlassen will -, gibt Leland Palmer vor, seine Nichte schon zum Busbahnhof gebracht zu haben. Tatsächlich fährt er Madeleines Leiche in seiner Golftasche durch die Gegend. Catherine Martell schickt Benjamin Horne eine Botschaft ins Gefängnis: Sie gibt ihm ein Alibi für die Mordnacht, wenn er ihr dafür das Grundstück des Sägewerks überschreibt. Dann findet die Polizei Madeleines Leiche ...

Endlich sind Agent Cooper und Sheriff Truman dem Mörder von Laura Palmer auf der Spur. Indizien sind u. a. die Leiche von Madeleine Ferguson, unter deren Fingernagel der Buchstabe "O" eingraviert ist - ein für den Mordfall bedeutsames Zeichen. Außerdem erhält Donna eine Seite aus Lauras geheimem Tagebuch mit wichtigen Hinweisen. Im "Roadhouse" versammelt Cooper alle Verdächtigen, nachdem er noch einmal den Riesen befragt hat: Ben Horne, Leland Palmer und Leo Johnson ...

Agent Dale Cooper hält den Mordfall Laura Palmer für abgeschlossen und will ein paar Tage Urlaub machen. Da taucht Coopers Kollege Roger Hardy auf und teilt ihm mit, dass er vom Dienst suspendiert wurde.

Agent Dale Cooper muss sich vor einem Untersuchungsausschuss verantworten. Ihm wird Rauschgifthandel und Mord vorgeworfen. Jocelyn erzählt Sheriff Truman, wer damals ihren Mann Andrew ermorden ließ.

Bobby Briggs erhält von Benjamin Horne den Auftrag, Hank Jennings zu beschatten. Er fotografiert diesen bei einem Treffen mit dem Verbrecher Jean Renault und Normas Stiefvater Ernie. Audrey stiehlt die brisanten Fotos und lässt sie Agent Cooper zukommen.

Dale Cooper und seine Kollegin Denise Bryson zwingen Ernie Niles, an einer fingierten Drogenübergabe teilzunehmen, um Jean Renault zu überführen. Die Übergabe misslingt. Renault nimmt Cooper als Geisel.

Dale Coopers Intimfeind, der wahnsinnige Windom Earle, versetzt Twin Peaks in Angst und Schrecken. Er will seinen Privatkrieg mit Cooper weiterführen und fordert ihn zu einem mörderischen Schachspiel heraus.

Der psychopathische Windom Earle hat Leo Johnson zu seinem Sklaven gemacht und bereitet mit ihm die nächsten Züge gegen Agent Cooper vor. Auch James ist in Bedrängnis: Seine Geliebte Evelyn Marsh hat ihren Mann ermordet und will ihm nun die Schuld in die Schuhe schieben.

Agent Cooper bittet Pete Martell, ihm bei dem mörderischen Schachspiel gegen Windom Earle zu helfen. Jocelyn Packard gerät unterdessen immer mehr in Bedrängnis: Cooper verdächtigt sie, ihren Assistenten Li ermordert zu haben.

Sheriff Truman kann den Tod seiner Verlobten Jocelyn nicht verwinden. Er nimmt erst einmal eine Auszeit vom Dienst. Unterdessen entlarvt Windom Earle Coopers letzten Schachzug als einen Trick, der zu einem Patt führen soll.

Thomas Eckhardts Vertraute Jones verübt einen Mordanschlag auf Truman. Der Schock weckt die Lebensgeister des Sheriffs und er beginnt wieder zu arbeiten. Dr. Hayward übergibt Cooper und Truman Earles letzten Schachzug.

Bei ihrer Rückkehr in die Eulenhöhle stellen Cooper und Sheriff Truman fest, dass Windom Earle auch dort war. Dieser ist auf der Suche nach der Schwarzen Hütte, einem Ort, der bösen Menschen übermenschliche Kräfte verleiht.

Windom Earle entführt Major Briggs, um von ihm Informationen über die Schwarze Hütte zu erhalten. Zur selben Zeit erhält Dale Cooper eine Warnung vom freundlichen Riesen.

Major Briggs gelingt die Flucht aus Earles Waldhütte. Er übergibt Dale Cooper eine kodierte Botschaft, aus der hervorgeht, dass Windom Earle plant, die 'Miss Twin Peaks' zu entführen. Die Zeit drängt, denn die Miss-Wahl ist bereits in vollem Gange.

Auf der Jagd nach Windom Earle, der Annie entführt hat, wagt sich Cooper durch das Tor zu einer anderen Welt in die sagenumwobene Schwarze Hütte. Dort, jenseits von Leben und Tod, beherrschen die Geister das Geschehen.