Beim morgendlichen Treffen in der Küche der Pfarrei St. Thomas werden die
Aufgaben der Woche verteilt und die Beerdigungen, Trauungen, Messen,
Taufen, Beichten sowie die zahlreichen sozialen Aufgaben in der Gemeinde
durchgesprochen. Pater Ray, der Pfarrer von St. Thomas, muss sich außerdem
auf eine Predigt zum Thema Gottesbeweise vorbereiten. Aber auf ihn kommen
schwerwiegendere Probleme zu: Im Beichtstuhl wird er von einem jungen
Mädchen wegen einer Abtreibung um Rat gebeten. Die Angelegenheit landet
schließlich beim Bischof, der Ray umgehend zu sich zitiert und verwarnt.
Daraufhin teilt Ray der Gemeinde mit, er werde ab sofort keine Beichten
mehr über sexuelle Angelegenheiten abnehmen, da er kein "Verkehrspolizist"
sei.

"Ich hasse Sonntage." Dieser Tag des Herrn ist allerdings dazu angetan,
Rays Aversion zu bestätigen: Der Anwalt Jack Martin, energischster Gegner
der Suppenküche für die Obdachlosen in St. Thomas, rückt mit einer
Journalistin und einem Kameramann im Schlepptau an, während sich in der
Kirche noch das übliche chaotische Bild bietet.

Zu allem Überfluss steht für heute auch noch die Hochzeit von J.A. und
Maritza auf dem Programm. Die Vorbereitungen sind eine einzige
Pannenserie. Maritzas Wagen bleibt liegen, so dass sich die Braut und ihr
Anhang in St. Thomas zurecht machen wollen, das Badezimmer aber nicht
benutzen können, da sich die Obdachlosen hier waschen. Weil J.A.s Scheck
geplatzt ist, muss der Empfang in die Suppenküche verlegt werden.
Daraufhin will Maritza die Hochzeit abblasen. Als Ray sie endlich
besänftigt hat, stellt Maureen entsetzt fest, dass sie das Hochzeitsessen
- einschließlich der Torte - bereits den Obdachlosen serviert hat. Jetzt
ist Improvisationstalent gefragt.

Wie jede Woche spricht der älteste Priester in Rays Pokerrunde einen Toast
aus - "auf die letzten heterosexuellen Priester der Welt". Aber einer von
ihnen ist schwul: Pater Jesse, ein alter Freund von Ray, der nach dem
Treffen tagelang von seiner Gemeinde vermisst wird. Als Ray seinen Freund
zu Hause aufsucht, macht Jesse ihm ein trauriges Geständnis: Er hat Aids.
Verzweifelt will er den Priesterberuf an den Nagel hängen und geht auf
Jobsuche. Während Ray versucht, ihn davon zu überzeugen, in der Kirche zu
bleiben, übernehmen die anderen Mitglieder von St. Thomas Rays tägliche
Pflichten.

St. Thomas steckt in Geldnöten. Da erweist es sich als glücklicher Zufall,
dass ein Lotterielos, das bei der Kollekte gespendet wurde, gewinnt.
Begeistert verplanen die Mitglieder der Pfarrei das zu erwartende Geld.
Eric sieht sich bei verschiedenen Autohändlern nach einem neuen Wagen um,
Mo gibt bei dem Künstler Antonio eine Heiligenstatue in Auftrag, der
marode Heizkessel soll endlich ersetzt werden, und ein E-mail-Anschluss
wäre auch noch drin. Leider entpuppt sich der Gewinn dann aber als nicht
so groß wie erwartet.

Pater Ray ist unterdessen ganz mit den Vorbereitungen für die Bestattung
von Grace Keneally beschäftigt. Ihre Familie ist völlig zerstritten, ihr
Mann kann Ray nicht leiden, und Leo weigert sich entschieden, die
Beerdigung zu übernehmen.

Rachel ist schwanger und sucht Rays Rat. Obwohl er ihr in der Beichte das
sagt, was die Kirche vorschreibt, macht er ihr auch klar, dass sie ganz
allein gemäß ihres Gewissens entscheiden muss. Maureen, bei der Rachel für
ein paar Tage unterkommen soll, weil sie sich nicht nach Hause traut, ist
schockiert, als sie von der Schwangerschaft erfährt.

Leo teilt Rays Meinung nicht. Er macht Rachel noch einmal den Standpunkt
der Kirche klar und bietet Rachel volle Unterstützung an, ob sie das Kind
behält oder zur Adoption freigibt. Aber Rachel erscheint am nächsten
Morgen nicht zum vereinbarten Treffen, sie hat ihre eigene Entscheidung
getroffen. Sidney ist unterdessen wegen der Schwierigkeiten mit seiner
Frau wieder zu seinen Eltern gezogen.

Nicht nur Pater Ray braucht dringend einen Tag Urlaub. Leo ist wütend,
dass seine Nichte nicht in einer katholischen Kirche heiraten wird und
frustriert, als seine Messe abgesagt und seine Pflichten anderen
übertragen werden. Zudem ist sein Freund bei den Anonymen Alkoholikern
rückfällig geworden. Frances will sich mit Sidney aussprechen, der sich
aber gerade mit einer attraktiven Frau auseinandersetzt, die in St. Thomas
einen Film drehen will.

Rachels Mutter hat von der Abtreibung erfahren und macht Ray dafür
verantwortlich. Der läuft zufällig seinem alten Freund Billy über den Weg,
der ihn daran erinnert, dass er in der High School immer von einer
Karriere als Rockstar geträumt hat. Tatsächlich muss Ray wieder auf die
Bühne, als er in einer Bar seine Rechnung nicht bezahlen kann.

Nachdem Leo ohne Erklärung verschwunden ist, fällt es Ray zunehmend
schwer, Kontakt zu Gott zu finden. Dann erscheint, während er die Messe
liest, auch noch seine Ex-Freundin Gemma in der Kirche, um die
Halloween-Feier der Gemeinde zu organisieren.

Ein Gemeindemitglied wendet sich an Schwester Maureen, weil seine Frau
sich in letzter Zeit stark verändert hat. Als Mo sich mit Camille trifft,
sind ihr deren Symptome nur allzu bekannt: Sie selbst hat sich vor sieben
Jahren so verhalten, nachdem sie beinahe vergewaltigt wurde.

Während J.A. feststellen muss, dass sein Cousin Octavio für einen
Drogendealer arbeitet, schmeißt Ray die Filmcrew raus, der - eine
willkommene Extraeinnahme - gestattet wurde, in der Kirche zu drehen.

Überraschend taucht Rays Bruder Michael, der gerade aus dem Gefängnis
entlassen wurde, in St. Thomas auf. Zwischen den Brüdern kommt es schnell
zu einem Streit. Zudem wird Michael wegen eines Raubüberfalls auf einen
Spirituosenladen gesucht.

Nathan, ein Seminarist, der ein paar Tage in der Gemeinde verbringt,
zweifelt Rays Fähigkeiten an und bringt so Eric in die ungewohnte
Position, den Pfarrer verteidigen zu müssen. Maureen gerät unterdessen in
einen Konflikt, als sie gebeten wird, in einer Episkopalkirche die Predigt
zu halten.

Ray wird ins Krankenhaus gerufen: Ein unbekannter junger Mann, den man auf
dem Dach eines Hotels gefunden hat, wurde dort eingeliefert. Er hat "in
Zungen" geredet und behauptet, Visionen der Heiligen Jungfrau zu sehen.
Der Arzt bekennt offen, er glaube nicht an Gott und sei überzeugt, der
Junge leide an Wahnvorstellungen. Aber Ray zieht tatsächlich in Erwägung,
dass der junge Mann eine ungewöhnliche religiöse Erfahrung gemacht hat.

Als der Junge plötzlich verschwindet, findet Ray ihn wieder auf dem
Hoteldach. Inzwischen wird seine Identität aufgeklärt: Es handelt sich um
Matt, der unter Depressionen leidet, seitdem seine Zwillingsschwester an
Leukämie gestorben ist. Eric entwickelt unterdessen Gefühle für die junge
Musikerin Margo, die eine mehrwöchige Drogen-Entgiftung hinter sich hat
und bei seiner Messe die Orgel spielen soll

Eines Nachts wird unmittelbar vor St. Thomas eine junge Frau angeschossen.
Als Sidney am nächsten Morgen eintrifft, macht er eine unglaubliche
Entdeckung: Die Blutlache auf dem Pflaster zeigt deutlich die Umrisse von
Jesus Christus. Ein Wunder?

Es stellt sich heraus, dass Angela versehentlich während einer Schießerei
zweier rivalisierender Straßengangs verletzt wurde. Ihr Bruder Paco macht
Guillermo Ortiz dafür verantwortlich, aber von dem erfährt Ray die ganze
Wahrheit: Guillermo sollte eigentlich das Opfer der Schießerei werden -
ihr eigener Bruder hat versehentlich auf Angela geschossen. Ray will Paco
dazu bringen, sich der Polizei zu stellen, aber es kommt anders: Paco
tötet Guillermo.

Ray feiert mit seinen alten Freunden Cabot und Jeanne Cole deren zehnten
Hochzeitstag, ohne zu ahnen, dass Alkohol und Gewalt längst die
Familienidylle zerstört haben. Garner, der Sohn der Coles, sucht heimlich
Zuflucht im Haus des verstorbenen Ehepaars Whitney, das seine ganze Habe
St. Thomas vermacht hat. Außerdem ist J.A. im Unterricht aufgefallen, dass
der Junge trinkt.

Als Jeanne mit einer Lebensmittelvergiftung ins Krankenhaus kommt, erzählt
die Krankenschwester Ray, dass die Frau schon mehrfach mit einer
Drogenüberdosis eingeliefert wurde. Sie fürchtet, dass Jeanne mit ihrem
nächsten Selbstmordversuch Erfolg haben wird. Ray, der durch die
Ereignisse schmerzlich an seine eigene Kindheit erinnert wird, versucht
die Ehe seiner Freunde zu retten.

Alles andere als friedlich verlaufen in diesem Jahr die Vorbereitungen für
die Weihnachtsfeier in St. Thomas. Mo kann ihren Zorn über ein rein
männlich ausgerichtetes Fest, bei dem sie keine Predigt halten darf, nicht
mehr zügeln: Sie droht, die Statue der Jungfrau Maria als Geisel zu
nehmen. Währenddessen flüchtet sich ein Paar in die Kirche, dem
Kopfgeldjäger und die Polizei auf den Fersen sind. Celia und Rigoberto
sind Kriegsflüchtlinge aus El Salvador.

Ray gewährt den beiden Kirchenasyl. Prompt sind wenige Stunden vor der
Mitternachtsmesse die Türen verschlossen, und die Kirche wird von der
Polizei umstellt. Als Leo sich mit einem der Ordnungshüter anlegt, landet
er hinter Gittern. Mit einem Trick können die Flüchtlinge entkommen: J.A.
und seine Schwester verkleiden sich als Celia und Rigoberto und werden den
Behörden übergeben. Aber Eric, der Rays Politik nicht unterstützt, funkt
dazwischen. Daraufhin findet er sich mit Ray und J.A. bei Leo im Gefängnis
wieder - und Schwester Mo muss schließlich allein die Mitternachtsmesse
abhalten.

"Eine rein weiße Kirche ist nicht meine Kirche." James Hamilton, einer der
Konfirmandenschüler, stellt seinen Platz in St. Thomas provokant in Frage,
indem er die Gesichter der Heiligen schwarz bemalt. Eine Herausforderung
für Ray, der versucht, den Jungen dazu zu bewegen, nicht zu den Baptisten
zu konvertieren.

Nach den Geschehnissen am Weihnachtsabend sieht sich Ray zunehmend vom
Bischof unter Druck gesetzt. Als dieser Beschwerdebriefe aus der Gemeinde
erhält, greift er zu drastischen Mitteln und stellt Ray Pater Martin
Briggs als "Aufpasser" zur Seite. Briggs stellt deutlich klar, dass Ray
seines Amtes enthoben wird, wenn sich die Zustände in St. Thomas nicht
ändern.

Verärgert über die Vorkommnisse während seiner Begrüßungsmesse,
unterstellt Pater Martin Briggs Mo, die Gemeinde gegen ihn aufzuhetzen.
Schwester Mo erhält zwar Rückendeckung von Ray, aber sie stellt ihre
Berufung als Nonne selbst in Frage, als sie sich mit ihrer Freundin Laura
trifft, die gerade ihre Hochzeit vorbereitet. Außerdem erfährt sie, dass
Schwester Sebastian gestorben ist.

Nach einem Streit mit ihrem Verlobten Jimmy sagt Laura die Trauung ab,
während Mo sich mit Schwester Lucy trifft und weiter ihren Erinnerungen -
auch an ihre Beziehung zu Jack, Lauras erstem Mann - nachhängt. Sie
bereitet Schwester Sebastians Beerdigung vor und versucht, Jimmy und Laura
auszusöhnen.

Die Reorganisierungs-Maßnahmen von Pater Martin Briggs sorgen weiterhin
für Unruhe in St. Thomas. Mo fühlt sich in ihrer Position von seiner neuen
Mitarbeitern Justine bedroht. Dann gibt Martin eines Morgens bekannt, dass
er die Suppenküche für die Obdachlosen schließen will. Ray verliert die
Geduld und macht Martin heftige Vorwürfe - dabei ist er selbst nicht ganz
unschuldig an der Schließung.

Ray nimmt Gregory Curtis die Beichte ab. Seine Frau erwartet ein Baby, das
am Down-Syndrom leidet, und der werdende Vater wird mit seiner Angst
einfach nicht fertig. Er will seine Frau verlassen und händigt Ray einen
Brief an sie aus. Der Pater besucht die schwangere Sarita Curtis und steht
schon im grünen Kittel im Kreißsaal, als Gregory im allerletzten Moment zu
seiner Frau zurückkehrt.

Rays Bruder Mike wurde angeschossen - von seinem eigenen Vater Vince, der
ihn für einen Einbrecher hielt. Im Gefängnis besteht Vince darauf, seinen
Sohn zu verklagen: Mike ist tatsächlich in das Haus seines Vaters
eingebrochen. Mike wird zu Gemeindearbeit in St. Thomas verurteilt - unter
Aufsicht von Ray, der heftig, aber vergeblich protestiert.

Eric verwandelt unterdessen St. Thomas aufgrund der eisigen Temperaturen
in ein Nachtasyl für Obdachlose. Kurze Zeit später trifft auch noch Rays
Mutter Helen in der Kirche ein und verkündet, sie habe ihren Mann
verlassen.

Die Hochzeitsvorbereitungen von Cecilia Horan und Hank Owens entwickeln
sich zu einer echten Herausforderung für Pater Ray. Die Familien der
Brautleute sind gegen die Verbindung, weil Hank Jude ist und Cecilia
katholisch. Der Rabbi musste aus gesundheitlichen Gründen absagen. Ray
bemüht sich trotzdem eine Zeremonie nach den Ritualen beider Religionen
vorzubereiten. Er versucht auch, die Eltern der beiden zum Kommen zu
bewegen. Besonders schwierig ist diese Mission bei den Owens: Es kommt zu
einem Familienstreit, in dessen Verlauf Hank damit droht, zum
Katholizismus überzutreten.

Sidney macht über das Internet einen Rabbi ausfindig: Judith Fischer. Sie
arrangiert gemeinsam mit Ray ein Zusammentreffen beider Familien. Die
hitzige Begegnung endet allerdings zunächst damit, dass die Hochzeit
abgesagt wird.

Sidney und Frances kommen sich wieder näher, mussten ihrem Eheberater aber
versprechen, enthaltsam zu sein. Justine versucht unterdessen, denjenigen
ausfindig zu machen, der in der Schule von St. Thomas Kondome verteilt.
Ray befürwortet die Aktion zwar insgeheim, beteiligt sich aber an den
Nachforschungen. Als Justines Freund in der Kirche auftaucht, kommt
allerdings heraus, dass auch sie nicht praktiziert, was sie so streng
predigt.

Rachel verliebt sich in Nick, der gerade aus dem Gefängnis entlassen wurde
und Arbeit in St. Thomas gefunden hat. Aber die Warnungen der anderen
bestätigen sich. Als Rachel in Nicks Auto unterwegs ist, wird sie von der
Polizei angehalten: Der Wagen ist gestohlen.

Ray kann nicht glauben, was er im Beichtstuhl hört: Dan Butcher erzählt
ihm, er sei als Kind von Pater Leo sexuell missbraucht worden. Am nächsten
Tag verkünden Dan und ein Anwalt in einer Pressekonferenz, dass sie Klage
erheben werden. Schwester Mary Germane, die Anwältin des Bischofs, rät Leo
sich einen eigenen Anwalt zu nehmen und jeden Kontakt zu Dan zu vermeiden.
Sie entbindet ihn außerdem von allen Pflichten.

Leo lehnt es ab, zu den Vorwürfen öffentlich Stellung zu beziehen. Aber
als Dan ein Angebot der Kirche - 250.000 Dollar und ein Jahr Therapie -
annimmt, protestiert er. Vater Martin Briggs enthüllt, dass auch er als
Messdiener missbraucht wurde und der Vikar den Fall damals auf dieselbe
Weise vertuscht habe. Bei der Gerichts-Anhörung stellt sich dann nicht nur
heraus, dass Leo nicht der Täter gewesen sein kann, sondern auch, dass er
weiß, wer Dan missbraucht hat: Vater Carl, Leos Freund bei den Anonymen
Alkoholikern.

Kurz vor Ostern wird Ray von Alpträumen heimgesucht. Sidney eröffnet ihm,
dass es tatsächlich Grund zur Panik gäbe: Martin habe dem Bischof
empfohlen, St. Thomas zu schließen. Als die Träume beunruhigender werden,
überzeugt Sidney Ray davon, seinen Stolz zu überwinden und Hilfe bei einem
Therapeuten zu suchen. Als er von einer der Sitzungen zurückkehrt, wünscht
Ray sich allerdings, er hätte nur geträumt, was er sieht: St. Thomas steht
in Flammen.

Während sie auf die Feuerwehr warten, versuchen Ray und die anderen
verzweifelt den Brand selbst zu löschen. Ray protestiert, als Martin die
Ostermesse nach St. Anne verlegen will. Unterdessen ertränkt Eric, der
sich für das Feuer verantwortlich fühlt, seine Schuldgefühle in Messwein.
Während der Aufräumarbeiten am nächsten Tag findet Ray im Müll ein
neugeborenes Baby. Ohne den verheerenden Brand wäre es nicht bemerkt
worden und gestorben.